Počas detstva sa venoval futbalu, no po zranení sa rozhodol pre herectvo. Študoval činoherné herectvo na Janáčkovej akadémii múzických umení (JAMU) v Brne, kde absolvoval v roku 2008. Počas štúdia hosťoval v Divadle U Stolu a HaDivadle.
Po absolvovaní JAMU sa stal členom činoherného súboru Městského divadla Brno, kde pôsobí dodnes.
V seriáli Lajna (2017), ktorý sa sústredí na príbeh bývalého hokejistu, ktorý sa snaží získať späť svoju kariéru, stvárnil Michal Isteník postavu Eduarda "Eda" Nováka, trénera hokejového tímu. V sitcome Psychosimona (2025) stvárnil Michal Isteník postavu Richarda, manžela hlavnej hrdinky Simony, ktorú hrá Zuzana Fialová.
Michal Isteník je tiež známy svojím záujmom o šport, najmä futbal, a stal sa tvárou českej internetovej televízie Telly, kde podporuje rozmanitosť trhu a ponuku športových programov.
